Hanna Lab bekerja sama dengan Chemivise Consultants (@chemivise), yaitu konsultan di bidang kimia, menawarkan suatu produk jasa simulasi molekuler yang sangat berguna untuk Klien dalam mengetahui dinamika yang terjadi pada molekul Klien serta profil interaksi antar molekul.
What We Serve For You
Simulasi kimia molekuler sangat bijak dan efektif untuk diaplikasikan. Hal ini karena penggunaan simulasi sebagai perilaku awal dalam research and develop suatu produk mampu mengurangi kesalahan yang terjadi ketika dilakukan wet experiment atau penelitian secara basah.
Perangkat simulasi yang kami gunakan adalah Scalable Molecular Dynamics Simulation (NAMD) dengan bahasa pemrograman C++ dan Visual Molecular Dynamics (VMD) sebagai perangkat visualisasi yang dikembangkan oleh Theoretical and Computational Biophysics Group, Universitas Illinois Urbana-Champaign. Perangkat NAMD sangat cocok untuk segala simulasi terutama pada makromolekul dengan jumlah molekul yang cukup besar. Hasil yang akan didapatkan berupa video hasil simulasi, berkas berisi analisis RMSD dan Total Energi dalam bentuk .pdf, lalu beberapa foto profil hasil simulasi.
What We Have Done
Sebelumnya tim berhasil melakukan simulasi coarse-grained dinamika molekuler pada spesies fosfoserin, fosfoetanolamin, dan fosfokolin yang diberi penambahan beberapa variasi konsentrasi kolesterol, 10 molekul vitamin C, dan 10 molekul beta-karoten. Spesies tersebut diantaranya 1,2-Dilauroyl-sn-glycero-3-phosphoserine (DLPS), 1,2-Dilauroyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DLPE), 1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoserine (DOPS), 1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DOPE), 1,2-Dilinoleoyl-sn-glycero-3-phosphoserine (DLiPS), 1,2-Dilinoleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DLiPE), dan 1,2-Dilinoleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DLiPC).
Tim berhasil mendapatkan profil agregasi dari sistem tersebut beserta dengan energi totalnya. Hasil simulasi tim telah dipublikasikan menjadi artikel dan dipresentasikan pada ISNPINSA 2021.
How To Contact Us
Klien dapat mengontak kami pada alamat email di sini atau kirim ke chemivise@gmail.com dengan mencantumkan subjek email "Chemistry Consultans_(Nama Projek Klien)_(Nama Klien)" dan memberi tahu kami projek Klien secara detail pada email tersebut. Kami tunggu Anda.
Regards,
Tim Hanna Lab.
Komentar
Posting Komentar